Test de paternidad microsatélites o VNTRs
En el caso de los test de paternidad, hoy en día se hacen por PCR seguida de un análisis de unos 9 a 13 VNTRs (numero variable de repeticiones en tandem del tipo de los minisatélites o secuencias de a 10 hasta 60 bases que se repiten) en una misma reacción seguida de la visualización en geles de poliacrilamida con la ayuda de un secuenciador automático.
En este caso se amplifican sitios específicos del genoma, que poseen un numero variable de secuencias repetidas. Por ejemplo: actgactgacgt- actgactgactg -actgactgactg actgactgatga- actgactgactg
En este ejemplo son 12 pb que se repiten 4 veces en uno de nuestros cromosomas (el materno o paterno) o sea que quizás yo (Gabriela) poseea 3 repeticiones en el materno y 10 en el paterno.
Otra persona podría tener 5 y 15, otra 10 y 12 etc.
Cuanto más variable es el numero de repeticiones, más precisa es la técnica. De este tipo de repeticiones se amplifican por PCR varias distintas (localizadas en distintas regiones del genoma) 9 a 13 en cada individuo y los fragmentos se ven luego en geles y se separan por tamaños.
El esquema de abajo muestra un ejemplo con sólo 3 repeticiones en el Individuo A, B y C. El tamaño de la banda de lo amplificado varía según el No de repeticiones que cada persona tenga.
Otros tipos son los STRs (short tandem repeats o repeticiones cortas en tandem de 2 a 6 pb de longitud que se repiten) Por ejemplo GCGA.GCGA.GCGA etc
Ejemplo de 3 VNTRs en 3 diferentes individuos. de Universidad de Arizona y traducido por Gabriela Iglesias
Ejemplo de 3 VNTRs en 3 diferentes individuos. Por ejemplo, se representan en distintos colores 3 pares de cromosomas homólogos y 3 VNTRs o repeticiones en tres cromosomas distintos. El No 1 en un cromosoma (azul ) con dos variantes en cada homólogo, por ejemplo en el materno 24 pares de bases (por ejemplo sea 6 repeticiones de 4 nucleótidos) y en el cromosoma paterno del Individuo A: unas 3 repeticiones de 4 bases: 12 nucleótidos en total.
Estos VNTRs al sembrarlos en un gel, da como resultado: dos bandas una de unas 24 pares de bases y una de 12 pares de bases. En la misma reacción de PCR se amplifican los tres minisatélites.
Por ende cada individuo muestra un patrón de bandas, producto de la cantidad de bases de cada repetición por el numero de bases que se repiten de cada VNTR amplificado .
este caso el individuo A tiene las bandas de 24 y 12 del VNTR 1, una de menos de 5 bases y una de 15 bases del cromosoma verde (VNTR 2) y una de 10 y otra de 30 del cromosoma rojo (VNTR 3). Este individuo A es heterocigota para los 3 VNTRs I
Usos como en los test de paternidad de los STRs y VNTRs. Cada hijo debería mostrar que cada banda de un VNTR proviene o del padre o de la madre. Como se ve en la Hija No 1 (D1), o el el Hijo (S1), en cambio en el caso de la hija 2 (D2) parte de sus bandas las hereda de la madre pero no tiene las otras bandas provenientes del padre, al menos no todas. Probablemente es hija de otro padre biológico. Finalmente el hijo S2 representado con bandas verdes, no comparte bandas ni del padre ni de la madre, por lo tanto podría ser un hijo no biológico. Imagen obtenida de DNA Profiling
Análisis de varios VNTRS al mismo tiempo Fuente: Sciencephotolibrary
Usos en la criminología o medicina forense en este caso con Southern blot y RFLP
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